Laboratorio di trascrittomica
Sede: IRCCS Maugeri Bari
Responsabile: Dott. Andrea Passantino
Responsabile: Dott. Andrea Passantino
Attività di ricerca
Nel laboratorio di trascrittomica è possibile eseguire le seguenti attività:
- Isolamento automatizzato di DNA, RNA a partire da: sangue; cellule; tessuti; fluidi biologici (es. siero, plasma urine, saliva, liquido cerebrospinale)
- Espressione genica (mRNA, miRNA, DNA o RNA virale, altri non-coding RNA)
- Genotyping (analisi di SNPs)
- High Resolution Melt (mutazioni, metilazione)
- Amplificazione di DNA (PCR)
- Retro-Trascrizione di RNA (RT)
- Espressione genica ed analisi dei miRNA (quantizzazione assoluta)
- Detection di mutazioni rare
- Detection di agenti patogeni (eg. carica virale)
- Analisi delle Copy Number Variations (CNVs)
- Liquid Biopsy (eg. Detection di DNA tumorale circolante – ctDNA; detection di DNA mitocondriale circolante – mtDNA, ecc..)
Apparecchiature qualificanti
- QIAcube
- QuantStudio™ 7 Pro Real-Time PCR System
- QIAxpert
- SimpliAmp
- QuantStudio™ 3D Digital PCR System
Pubblicazioni più significative
- Charitos IA, Aliani M, Tondo P, Venneri M, Castellana G, Scioscia G, Castellaneta F, Lacedonia D, Carone M Biomolecular Actions by Intestinal Endotoxemia in Metabolic Syndrome. .Int J Mol Sci. 2024 Feb 29;25(5):2841
- Venneri M, Passantino A MiRNA: what clinicians need to know. .Eur J Intern Med. 2023 Jul;113:6-9
- Venneri M, Vezzi V, Di Mise A, Ranieri M, Centrone M, Tamma G, Nejsum LN, Valenti G Novel signalling pathways in nephrogenic syndrome of inappropriate antidiuresis: functional implication of site-specific AQP2 phosphorylation. J Physiol. 2023 Feb 23